榮譽榜-政府機構

教育部
國家講座
2003
第7屆伊林教授(物理系)
2006
第10屆李弘謙教授(物理系)
葉永烜教授(天文所)
2007
第11屆李光華教授(化學系)
學術獎
1997
伊林教授(物理系)
1997
鄭光甫教授(統研所)
2004
李光華教授(化學系)
國科會
特約研究人員
1999
伊林教授(物理系)
2001
胡紀如教授(化學系)
2006
李光華教授(化學系)
2007
許順吉教授(數學系)
傑出研究獎
1996
伊林教授(物理系)
2000
李弘謙教授(物理系)
2000
黎璧賢教授(物理系)
2003
李光華教授(化學系)
2004
王金龍教授(數學系)
2007
徐子民教授(物理系)
2008
李正中教授(光電科學與工程學系)
2009
孫慶成教授(光電科學與工程學系)
2010
阮啟弘副教授 (認知所)
吳大猷先生紀念獎
2002
王金龍教授(數學系)
2006
陳啟昌教授(光電科學與工程學系)
2007
許正雄副教授(數學系)
績優技術獎
2009
李正中教授(光電科學與工程學系)
傑出技轉貢獻獎
2009
李正中教授(光電科學與工程學系)

國科會國家理論科學研究中心(NCTS)
年輕理論學者獎
2006
許正雄教授(數學系)
2008
李明憶教授(數學系)
經濟部
大學產業經濟貢獻獎-產業深耕獎
2007
李正中教授(光電科學與工程學系)
2009
孫慶成教授(光電科學與工程學系)

中研院
院士
2008
伊林教授(物理系)
年輕學者研究著作獎
1999
張元翰教授(物理系)
2002
陳培亮教授(物理系)
2005
王健家教授(生科系)
2006
阮啟弘副教授 (認知所)
2008
邱鴻麟教授(數學系)